日本植物細胞分子生物学会、バイオインフォマティクス講習会

Rのインストールと設定について

Rインストールと設定上の注意


バイオインフォマティクス講習会「Rを使用した遺伝情報解析方法」(2014.8.22日本植物細胞分子生物学会)

使用するパッケージは、multcomp,
チューキー・クレーマー検定の手順
rice10var.txt(例データ)
tukey_code.txt(チューキー検定用コード)


チューキー・クレーマー検定の手順(45種類以上の場合)
rice112var.txt(例データ,45種以上)
tukey_code2.txt(チューキー検定用コード,45種以上)


ダネット検定の手順
OXs.txt(ダネット用例データ)
dunnett_code.txt(ダネット検定用コード)

バイオインフォマティクス講習会「RでQTL解析」(2013.9.12日本植物細胞分子生物学会)

Rとqtlパッケージの導入・準備
テストデータ1

QTL解析手順(singleQTLとTwo-QTLスキャン)
テストデータ2

xQTL解析、オーミックデータへの対応
テストデータ3(RILs)


R/qtlによる連鎖地図作成






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