日本植物細胞分子生物学会、バイオインフォマティクス講習会

Rのインストールと設定について

・Rインストールと設定上の注意


バイオインフォマティクス講習会「Rを使用した遺伝情報解析方法」(2014.8.22日本植物細胞分子生物学会）

使用するパッケージは、multcomp,
・チューキー・クレーマー検定の手順
・rice10var.txt(例データ)
・tukey_code.txt(チューキー検定用コード)


・チューキー・クレーマー検定の手順(45種類以上の場合)
・rice112var.txt(例データ,45種以上)
・tukey_code2.txt(チューキー検定用コード,45種以上)


・ダネット検定の手順
・OXs.txt(ダネット用例データ)
・dunnett_code.txt(ダネット検定用コード)

バイオインフォマティクス講習会「RでQTL解析」(2013.9.12日本植物細胞分子生物学会）

・Rとqtlパッケージの導入・準備
・テストデータ1

・QTL解析手順(singleQTLとTwo-QTLスキャン)
・テストデータ2

・xQTL解析、オーミックデータへの対応
・テストデータ3(RILs)


・R/qtlによる連鎖地図作成






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