16世紀の宗教改革を経て17世紀にイギリスで生まれプロテスタントの一派で、19世紀後半にアメリカの南部バプテスト連盟の宣教師たちが来日してその基礎が作られました。黒人解放・公民権運動で知られるマルチン・ルーサー・キング牧師もバプテストでした。

　日本全国の３００を越える日本バプテスト連盟の教会は、それぞれ独立自治でありながら互いに協力する関係にあります。

　京都の日本バプテスト病院や福岡の西南学院、久山療育園(重度心身障がい者施設)、北九州の西南女学院、なども同じ系列です。

　日本バプテスト連盟はバプテスト教会が協力して伝道に取り組むために結成された教会の協力体です。